[補説]日本農業遺産認定の24地域 ※はGIAHS（世界農業遺産）認定地
岩手県束稲山麓地域「束稲山麓地域の災害リスク分散型土地利用システム」 （令和5年）
宮城県大崎地域「『大崎耕土』の巧みな水管理による水田システム」（平成28年）※
山形県最上川流域「歴史と伝統がつなぐ山形の「最上紅花」—日本で唯一、世界でも稀有な紅花生産・染色用加工システム—」（平成30年）
埼玉県武蔵野地域「大都市近郊に今も息づく武蔵野の落ち葉堆肥農法」（平成28年）※
埼玉県比企丘陵地域「比企丘陵の天水を利用した谷津沼農業システム」（令和5年）
山梨県峡東地域「峡東地域の扇状地に適応した果樹農業システム」（平成28年）※
静岡県わさび栽培地域「静岡水わさびの伝統栽培」（平成28年）※
新潟県中越地域「雪の恵みを活かした稲作・養鯉システム」（平成28年）
富山県氷見地域「氷見の持続可能な定置網漁業」（令和2年）
福井県三方五湖地域「三方五湖の汽水湖沼群漁業システム」（平成30年）
三重県鳥羽・志摩地域「鳥羽・志摩の海女漁業と真珠養殖業」（平成28年）
三重県尾鷲市、紀北町「急峻な地形と日本有数の多雨が生み出す尾鷲ヒノキ林業」（平成28年）
滋賀県琵琶湖地域「森・里・湖 (うみ) に育まれる漁業と農業が織りなす琵琶湖システム」（平成30年）※
兵庫県兵庫美方地域「人と牛が共生する美方地域の伝統的但馬牛飼育システム」（平成30年）※
兵庫県丹波篠山地域「丹波篠山の黒大豆栽培〜ムラが支える優良種子と家族農業〜」（令和2年）
兵庫県南あわじ地域「南あわじにおける水稲・たまねぎ・畜産の生産循環システム」（令和2年）
和歌山県海南市下津地域「下津蔵出しみかんシステム」（平成30年）
和歌山県高野・花園・清水地域「聖地高野山と有田川上流域を結ぶ持続的農林業システム」（令和2年）
和歌山県有田地域「みかん栽培の礎を築いた有田みかんシステム」（令和2年）
徳島県にし阿波地域「にし阿波の傾斜地農耕システム」（平成28年）※
島根県奥出雲地域「たたら製鉄に由来する奥出雲の資源循環型農業」（平成30年）
愛媛県南予地域「愛媛・南予の柑橘農業システム」（平成30年）
宮崎県日南市「造船材を産出した飫肥林業と結びつく「日南かつお一本釣り漁業」」（令和2年）
宮崎県田野・清武地域「宮崎の太陽と風が育む「干し野菜」と露地畑作の高度利用システム」（令和2年）