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真菌によって引き起こされる疾患の総称。主にカンジダ菌により皮膚に起こるものと、カンジダ菌・放線菌などにより内臓に起こるものとがある。免疫の低下しているときに日和見 (ひよりみ) 感染として発病することが多い。

[補説]感染部位の深さによって、深在性真菌症(内臓真菌症・全身性真菌症)、深部皮膚真菌症(皮下真菌症)、表在性真菌症(浅在性真菌症)に分類される。