[補説]日本農業遺産認定の28地域 ※はGIAHS（世界農業遺産）認定地
岩手県束稲 (たばしね) 山麓地域「束稲山麓地域の災害リスク分散型土地利用システム」
宮城県大崎地域 「『大崎耕土』の巧みな水管理による水田システム」※
山形県最上川流域「歴史と伝統がつなぐ山形の「最上紅花 (べにばな) 」〜日本で唯一、世界でも稀有な紅花生産・染色用加工システム〜」
埼玉県武蔵野地域 「大都市近郊に今も息づく武蔵野の落ち葉堆肥農法」※
埼玉県比企 (ひき) 丘陵地域「比企丘陵の天水を利用した谷津沼 (やつぬま) 農業システム」
山梨県峡東地域 「峡東地域の扇状地に適応した果樹農業システム」※
静岡県わさび栽培地域 「静岡水わさびの伝統栽培」※
新潟県中越地域 「雪の恵みを活かした稲作・養鯉システム」
富山県氷見地域「氷見の持続可能な定置網漁業」
福井県三方五湖地域「三方五湖の汽水湖沼群漁業システム」
三重県鳥羽・志摩地域 「鳥羽・志摩の海女漁業と真珠養殖業」
三重県尾鷲市、紀北町 「急峻な地形と日本有数の多雨が生み出す尾鷲ヒノキ林業」
滋賀県琵琶湖地域「森・里・湖 (うみ) に育まれる漁業と農業が織りなす琵琶湖システム」※
兵庫県兵庫美方 (みかた) 地域「人と牛が共生する美方地域の伝統的但馬牛飼育システム」※
兵庫県丹波篠山地域「丹波篠山の黒大豆栽培〜ムラが支える優良種子と家族農業〜」
兵庫県朝来 (あさご) 地域「岩津ねぎを核とした資源循環型農業システム＝伝統種子の継承と地域連携による里地里山保全＝」
兵庫県北播磨・六甲山北部地域「兵庫の酒米「山田錦」生産システム」
兵庫県南あわじ地域「南あわじにおける水稲・たまねぎ・畜産の生産循環システム」
和歌山県海南市下津地域「下津蔵出しみかんシステム」
和歌山県高野・花園・清水地域「聖地高野山と有田川上流域を結ぶ持続的農林業システム」
和歌山県有田地域「みかん栽培の礎を築いた有田みかんシステム」
徳島県にし阿波地域 「にし阿波の傾斜地農耕システム」※
徳島県県南地域「みなみ阿波の樵木 (こりき) 林業システム—照葉樹林に育まれた里山、里海の物語—」
島根県奥出雲 (おくいずも) 地域「たたら製鉄に由来する奥出雲の資源循環型農業」
愛媛県南予地域「愛媛・南予の柑橘農業システム」
宮崎県日南市「造船材を産出した飫肥 (おび) 林業と結びつく「日南かつお一本釣り漁業」」
宮崎県田野・清武地域「宮崎の太陽と風が育む「干し野菜」と露地畑作の高度利用システム」
沖縄県多良間 (たらま) 地域「琉球王国時代の「抱護 (ポーグ) 」が育む多良間島の持続的島嶼 (とうしょ) 農業システム」